Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pacs2Q3V3Q7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pacs2Q3V3Q7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms