Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Psme1P97371 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Psme1P97371 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psme1P97371 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms