Protein–RNA interactions for Protein: P51683

Ccr2, C-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr2P51683 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccr2P51683 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccr2P51683 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms