Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RhoP15409 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RhoP15409 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RhoP15409 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RhoP15409 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RhoP15409 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RhoP15409 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhoP15409 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms