Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna3O08545 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna3O08545 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms