Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
1700019A02RikA0A087WPV9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms