Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.2 ms