Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SgshQ9EQ08 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SgshQ9EQ08 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms