Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6030-201ENSMUST00000078768 402 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.5 ms