Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Mir6926-201ENSMUST00000184562 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Rpusd2Q149F1 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Rpusd2Q149F1 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234 ms