Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm45130-201ENSMUST00000207574 3388 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm8041-201ENSMUST00000199755 616 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.2 ms