Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SgshQ9EQ08 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SgshQ9EQ08 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.5 ms