Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trpv2Q9WTR1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trpv2Q9WTR1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms