Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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Gpc1Q9QZF2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gpc1Q9QZF2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gpc1Q9QZF2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gpc1Q9QZF2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Gpc1Q9QZF2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpc1Q9QZF2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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