Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Edf1Q9JMG1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Edf1Q9JMG1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms