Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Col5a3Q9JLI2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col5a3Q9JLI2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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