Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3glb1Q9JK48 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms