Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zcchc8Q9CYA6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zcchc8Q9CYA6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms