Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms