Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ssxb10Q6XAR7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssxb10Q6XAR7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssxb10Q6XAR7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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