Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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