Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx6-3Q3UHX8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Nkx6-3Q3UHX8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms