Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Psme1P97371 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Psme1P97371 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms