Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Epb41P48193 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Epb41P48193 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms