Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NclP09405 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NclP09405 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NclP09405 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NclP09405 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NclP09405 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NclP09405 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NclP09405 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NclP09405 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NclP09405 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NclP09405 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NclP09405 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NclP09405 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NclP09405 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NclP09405 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NclP09405 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NclP09405 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms