Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Hoxb3P09026 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxb3P09026 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms