Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Efna3O08545 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms