Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf1B2RRD7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brpf1B2RRD7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms