Protein–RNA interactions for Protein: A2ADA5

Pusl1, tRNA pseudouridine synthase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pusl1A2ADA5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pusl1A2ADA5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pusl1A2ADA5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms