Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Col9a3A2ACT7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a3A2ACT7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms