Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Subh2bvQ9D9Z7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms