Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spns3Q9D232 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Spns3Q9D232 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Spns3Q9D232 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Spns3Q9D232 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms