Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM11

Tgm6, Transglutaminase 6, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tgm6Q8BM11 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgm6Q8BM11 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgm6Q8BM11 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgm6Q8BM11 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tgm6Q8BM11 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tgm6Q8BM11 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tgm6Q8BM11 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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