Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnot1Q6ZQ08 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms