Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NipblQ6KCD5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NipblQ6KCD5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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