Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Mdc1Q5PSV9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mdc1Q5PSV9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms