Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Xrn1P97789 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Xrn1P97789 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms