Protein–RNA interactions for Protein: V9GXS8

Gm11983, Predicted gene 11983, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11983V9GXS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm11983V9GXS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm11983V9GXS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm11983V9GXS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm11983V9GXS8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gm11983V9GXS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm11983V9GXS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm11983V9GXS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm11983V9GXS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm11983V9GXS8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11983V9GXS8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11983V9GXS8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm11983V9GXS8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11983V9GXS8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm11983V9GXS8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms