Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PdfS4R2K0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdfS4R2K0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PdfS4R2K0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdfS4R2K0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms