Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfwd2Q9R1A8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfwd2Q9R1A8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfwd2Q9R1A8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfwd2Q9R1A8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rfwd2Q9R1A8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms