Protein–RNA interactions for Protein: Q9R100

Cdh17, Cadherin-17, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh17Q9R100 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh17Q9R100 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh17Q9R100 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh17Q9R100 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh17Q9R100 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh17Q9R100 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh17Q9R100 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh17Q9R100 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms