Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tnnt3Q9QZ47 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Tnnt3Q9QZ47 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tnnt3Q9QZ47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Tnnt3Q9QZ47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Tnnt3Q9QZ47 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tnnt3Q9QZ47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tnnt3Q9QZ47 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Tnnt3Q9QZ47 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tnnt3Q9QZ47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Tnnt3Q9QZ47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms