Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp1Q9QY53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nphp1Q9QY53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nphp1Q9QY53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp1Q9QY53 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp1Q9QY53 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Nphp1Q9QY53 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Nphp1Q9QY53 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Nphp1Q9QY53 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.6 ms