Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Kcnip3Q9QXT8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Kcnip3Q9QXT8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Kcnip3Q9QXT8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms