Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Alyref2Q9JJW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Alyref2Q9JJW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Alyref2Q9JJW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Alyref2Q9JJW6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Alyref2Q9JJW6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms