Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Zfhx4Q9JJN2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zfhx4Q9JJN2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfhx4Q9JJN2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Zfhx4Q9JJN2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfhx4Q9JJN2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfhx4Q9JJN2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfhx4Q9JJN2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms