Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Scn4aQ9ER60 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Scn4aQ9ER60 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Scn4aQ9ER60 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Scn4aQ9ER60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Scn4aQ9ER60 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Scn4aQ9ER60 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Scn4aQ9ER60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Scn4aQ9ER60 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Scn4aQ9ER60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Scn4aQ9ER60 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Scn4aQ9ER60 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Scn4aQ9ER60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Scn4aQ9ER60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms