Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Upf1Q9EPU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Upf1Q9EPU0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Upf1Q9EPU0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Upf1Q9EPU0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Upf1Q9EPU0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf1Q9EPU0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf1Q9EPU0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf1Q9EPU0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Upf1Q9EPU0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Upf1Q9EPU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Upf1Q9EPU0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Upf1Q9EPU0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Upf1Q9EPU0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Upf1Q9EPU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Upf1Q9EPU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms