Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Bap18Q9DCT6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bap18Q9DCT6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bap18Q9DCT6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bap18Q9DCT6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bap18Q9DCT6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms