Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ5

Eif3k, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3kQ9DBZ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3kQ9DBZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eif3kQ9DBZ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eif3kQ9DBZ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eif3kQ9DBZ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3kQ9DBZ5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms